Add logs for file_array improvement
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8113f714de
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ae0040bf6e
@ -1,8 +1,11 @@
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#include "genlib.h"
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#include "genlib.h"
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#include <math.h>
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#include <math.h>
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#include <stdio.h>
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#include <stdio.h>
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#include "log.h"
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/*exponential covariance function*/
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/*exponential covariance function*/
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double exponential(double h) {
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double exponential(double h) {
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log_info("RESULT = in progress, h = %f", h);
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return (exp(-3. * (double)h));
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return (exp(-3. * (double)h));
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}
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}
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@ -1,15 +1,50 @@
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#include "genlib.h"
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#include "genlib.h"
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#include "log.h"
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#include "memory.h"
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#include <math.h>
|
#include <math.h>
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#include <stdio.h>
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#include <stdio.h>
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#include <time.h>
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#include <time.h>
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/*gamma covariance function*/
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/*gamma covariance function*/
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double gammf(double h, double alpha) {
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double gammf(double h, double alpha, int cores) {
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double* used_ram_t0 = malloc(sizeof(double));
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getVirtualMemUsed(used_ram_t0);
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clock_t t = clock();
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log_info("RESULT = in progress, h = %f, alpha = %f", h, alpha);
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struct cpustat initial[cores];
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struct cpustat final[cores];
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for (int i = 0; i < cores; i++) {
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get_stats(&initial[i], i - 1);
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}
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float delta;
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float delta;
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double z;
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double z;
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delta = pow(20., 1. / alpha) - 1.;
|
delta = pow(20., 1. / alpha) - 1.;
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z = 1. / (double)(pow(1. + h * delta, alpha));
|
z = 1. / (double)(pow(1. + h * delta, alpha));
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t = clock() - t;
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double time_taken = ((double)t)/CLOCKS_PER_SEC; // calculate the elapsed time
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for (int i = 0; i < cores; i++) {
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get_stats(&final[i], i - 1);
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}
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for (int i = 0; i < cores; i++) {
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log_info("CPU %d: %lf%%", i, calculate_load(&initial[i], &final[i]));
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}
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double* used_ram_tf = malloc(sizeof(double));
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getVirtualMemUsed(used_ram_t0);
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log_info("RESULT = success, delta = %f, z = %f, ELAPSED = %f seconds, DIF USED VIRTUAL MEM = %5.1f MB", delta, z, time_taken, *used_ram_tf - *used_ram_t0);
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free(used_ram_t0);
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free(used_ram_tf);
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return z;
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return z;
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}
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}
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@ -1,8 +1,10 @@
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#include "genlib.h"
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#include "genlib.h"
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#include "log.h"
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#include <math.h>
|
#include <math.h>
|
||||||
#include <stdio.h>
|
#include <stdio.h>
|
||||||
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||||||
/*gaussian covariance function*/
|
/*gaussian covariance function*/
|
||||||
double gaussian(double h) {
|
double gaussian(double h) {
|
||||||
|
log_info("RESULT = in progress, h = %f", h);
|
||||||
return (exp(-3. * (double)(h * h)));
|
return (exp(-3. * (double)(h * h)));
|
||||||
}
|
}
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@ -0,0 +1,177 @@
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|
/*
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|
* Copyright (c) 2020 rxi
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|
*
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|
* Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
|
||||||
|
* of this software and associated documentation files (the "Software"), to
|
||||||
|
* deal in the Software without restriction, including without limitation the
|
||||||
|
* rights to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or
|
||||||
|
* sell copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
|
||||||
|
* furnished to do so, subject to the following conditions:
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||||||
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*
|
||||||
|
* The above copyright notice and this permission notice shall be included in
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||||||
|
* all copies or substantial portions of the Software.
|
||||||
|
*
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||||||
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* THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
|
||||||
|
* IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
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||||||
|
* FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
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||||||
|
* AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
|
||||||
|
* LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING
|
||||||
|
* FROM, OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS
|
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|
* IN THE SOFTWARE.
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*/
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|
#include <stdlib.h>
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|
#include "log.h"
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#include <string.h>
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#define MAX_CALLBACKS 32
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typedef struct {
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log_LogFn fn;
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void *udata;
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int level;
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} Callback;
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static struct {
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|
void *udata;
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log_LockFn lock;
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|
int level;
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bool quiet;
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|
Callback callbacks[MAX_CALLBACKS];
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} L;
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|
|
||||||
|
static const char *level_strings[] = {
|
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|
"TRACE", "DEBUG", "INFO", "WARN", "ERROR", "FATAL"
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||||||
|
};
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||||||
|
|
||||||
|
#ifdef LOG_USE_COLOR
|
||||||
|
static const char *level_colors[] = {
|
||||||
|
"\x1b[94m", "\x1b[36m", "\x1b[32m", "\x1b[33m", "\x1b[31m", "\x1b[35m"
|
||||||
|
};
|
||||||
|
#endif
|
||||||
|
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||||||
|
|
||||||
|
static void stdout_callback(log_Event *ev) {
|
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|
char buf[16];
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||||||
|
buf[strftime(buf, sizeof(buf), "%H:%M:%S", ev->time)] = '\0';
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#ifdef LOG_USE_COLOR
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|
fprintf(
|
||||||
|
ev->udata, "%s %s%-5s\x1b[0m \x1b[0m%s:%d:\x1b[0m ",
|
||||||
|
buf, level_colors[ev->level], level_strings[ev->level],
|
||||||
|
ev->file, ev->line);
|
||||||
|
#else
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||||||
|
fprintf(
|
||||||
|
ev->udata, "%s %-5s %s:%d: ",
|
||||||
|
buf, level_strings[ev->level], ev->file, ev->line);
|
||||||
|
#endif
|
||||||
|
vfprintf(ev->udata, ev->fmt, ev->ap);
|
||||||
|
fprintf(ev->udata, "\n");
|
||||||
|
fflush(ev->udata);
|
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|
}
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|
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|
static void file_callback(log_Event *ev) {
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|
char buf[64];
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||||||
|
buf[strftime(buf, sizeof(buf), "%Y-%m-%d %H:%M:%S", ev->time)] = '\0';
|
||||||
|
fprintf(
|
||||||
|
ev->udata, "%s %-5s %s:%d: ",
|
||||||
|
buf, level_strings[ev->level], ev->file, ev->line);
|
||||||
|
vfprintf(ev->udata, ev->fmt, ev->ap);
|
||||||
|
fprintf(ev->udata, "\n");
|
||||||
|
fflush(ev->udata);
|
||||||
|
}
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static void lock(void) {
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if (L.lock) { L.lock(true, L.udata); }
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|
}
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static void unlock(void) {
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if (L.lock) { L.lock(false, L.udata); }
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|
}
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const char* log_level_string(int level) {
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|
return level_strings[level];
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}
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void log_set_lock(log_LockFn fn, void *udata) {
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|
L.lock = fn;
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|
L.udata = udata;
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|
}
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|
void log_set_level(int level) {
|
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|
L.level = level;
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|
}
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|
void log_set_quiet(bool enable) {
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|
L.quiet = enable;
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}
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|
int log_add_callback(log_LogFn fn, void *udata, int level) {
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|
for (int i = 0; i < MAX_CALLBACKS; i++) {
|
||||||
|
if (!L.callbacks[i].fn) {
|
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|
L.callbacks[i] = (Callback) { fn, udata, level };
|
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|
return 0;
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}
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|
}
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|
return -1;
|
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|
}
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|
int log_add_fp(FILE *fp, int level) {
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|
return log_add_callback(file_callback, fp, level);
|
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|
}
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|
static void init_event(log_Event *ev, void *udata) {
|
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|
if (!ev->time) {
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|
time_t t = time(NULL);
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|
ev->time = localtime(&t);
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|
}
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|
ev->udata = udata;
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|
}
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|
void log_log(int level, const char *file, int line, const char *fmt, ...) {
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|
log_Event ev = {
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||||||
|
.fmt = fmt,
|
||||||
|
.file = file,
|
||||||
|
.line = line,
|
||||||
|
.level = level,
|
||||||
|
};
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||||||
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|
char* env_var = getenv("ENV");
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|
if (env_var != NULL && strcmp("false", env_var) == 0) return;
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|
char* substr_mem = strstr(fmt, "MEM");
|
||||||
|
char* substr_cpu = strstr(fmt, "CPU");
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||||||
|
if (env_var != NULL && strcmp("analysis", env_var) == 0 && substr_mem == NULL && substr_cpu == NULL) return;
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|
lock();
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|
if (!L.quiet && level >= L.level) {
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|
init_event(&ev, stderr);
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|
va_start(ev.ap, fmt);
|
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|
stdout_callback(&ev);
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|
va_end(ev.ap);
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|
}
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|
for (int i = 0; i < MAX_CALLBACKS && L.callbacks[i].fn; i++) {
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|
Callback *cb = &L.callbacks[i];
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|
if (level >= cb->level) {
|
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|
init_event(&ev, cb->udata);
|
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|
va_start(ev.ap, fmt);
|
||||||
|
cb->fn(&ev);
|
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|
va_end(ev.ap);
|
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|
}
|
||||||
|
}
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||||||
|
|
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|
unlock();
|
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|
}
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@ -0,0 +1,49 @@
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/**
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|
* Copyright (c) 2020 rxi
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*
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|
* This library is free software; you can redistribute it and/or modify it
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|
* under the terms of the MIT license. See `log.c` for details.
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*/
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|
#ifndef LOG_H
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|
#define LOG_H
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#include <stdio.h>
|
||||||
|
#include <stdarg.h>
|
||||||
|
#include <stdbool.h>
|
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|
#include <time.h>
|
||||||
|
|
||||||
|
#define LOG_VERSION "0.1.0"
|
||||||
|
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|
typedef struct {
|
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|
va_list ap;
|
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|
const char *fmt;
|
||||||
|
const char *file;
|
||||||
|
struct tm *time;
|
||||||
|
void *udata;
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|
int line;
|
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|
int level;
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} log_Event;
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|
typedef void (*log_LogFn)(log_Event *ev);
|
||||||
|
typedef void (*log_LockFn)(bool lock, void *udata);
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|
enum { LOG_TRACE, LOG_DEBUG, LOG_INFO, LOG_WARN, LOG_ERROR, LOG_FATAL };
|
||||||
|
|
||||||
|
#define log_trace(...) log_log(LOG_TRACE, __FILE__, __LINE__, __VA_ARGS__)
|
||||||
|
#define log_debug(...) log_log(LOG_DEBUG, __FILE__, __LINE__, __VA_ARGS__)
|
||||||
|
#define log_info(...) log_log(LOG_INFO, __FILE__, __LINE__, __VA_ARGS__)
|
||||||
|
#define log_warn(...) log_log(LOG_WARN, __FILE__, __LINE__, __VA_ARGS__)
|
||||||
|
#define log_error(...) log_log(LOG_ERROR, __FILE__, __LINE__, __VA_ARGS__)
|
||||||
|
#define log_fatal(...) log_log(LOG_FATAL, __FILE__, __LINE__, __VA_ARGS__)
|
||||||
|
|
||||||
|
const char* log_level_string(int level);
|
||||||
|
void log_set_lock(log_LockFn fn, void *udata);
|
||||||
|
void log_set_level(int level);
|
||||||
|
void log_set_quiet(bool enable);
|
||||||
|
int log_add_callback(log_LogFn fn, void *udata, int level);
|
||||||
|
int log_add_fp(FILE *fp, int level);
|
||||||
|
|
||||||
|
void log_log(int level, const char *file, int line, const char *fmt, ...);
|
||||||
|
|
||||||
|
#endif
|
@ -0,0 +1,94 @@
|
|||||||
|
#include <sys/types.h>
|
||||||
|
#include <sys/sysinfo.h>
|
||||||
|
#include <stdlib.h>
|
||||||
|
#include <stdio.h>
|
||||||
|
#include <string.h>
|
||||||
|
#include <sys/times.h>
|
||||||
|
#include <sys/vtimes.h>
|
||||||
|
#include <unistd.h>
|
||||||
|
#include "log.h"
|
||||||
|
#include "memory.h"
|
||||||
|
|
||||||
|
static unsigned long long lastTotalUser, lastTotalUserLow, lastTotalSys, lastTotalIdle;
|
||||||
|
static clock_t lastCPU, lastSysCPU, lastUserCPU;
|
||||||
|
static int numProcessors;
|
||||||
|
|
||||||
|
void getTotalVirtualMem(double* total_ram) {
|
||||||
|
const double megabyte = 1024 * 1024;
|
||||||
|
struct sysinfo si;
|
||||||
|
sysinfo(&si);
|
||||||
|
*total_ram = si.totalram / megabyte;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
void getVirtualMemUsed(double* used_ram) {
|
||||||
|
const double megabyte = 1024 * 1024;
|
||||||
|
struct sysinfo si;
|
||||||
|
sysinfo(&si);
|
||||||
|
*used_ram = (si.totalram - si.freeram) / megabyte;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
int parseLine(char* line) {
|
||||||
|
// This assumes that a digit will be found and the line ends in " Kb".
|
||||||
|
int i = strlen(line);
|
||||||
|
const char* p = line;
|
||||||
|
while (*p <'0' || *p > '9') p++;
|
||||||
|
line[i-3] = '\0';
|
||||||
|
i = atoi(p);
|
||||||
|
return i;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
int getVirtualMemUsedByCurrentProcess() {
|
||||||
|
FILE* file = fopen("/proc/self/status", "r");
|
||||||
|
int result = -1;
|
||||||
|
char line[128];
|
||||||
|
|
||||||
|
while (fgets(line, 128, file) != NULL){
|
||||||
|
if (strncmp(line, "VmSize:", 7) == 0){
|
||||||
|
result = parseLine(line);
|
||||||
|
break;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
fclose(file);
|
||||||
|
return result / 1024;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
void skip_lines(FILE *fp, int numlines) {
|
||||||
|
int cnt = 0;
|
||||||
|
char ch;
|
||||||
|
while ((cnt < numlines) && ((ch = getc(fp)) != EOF)) {
|
||||||
|
if (ch == '\n') cnt++;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
void get_stats(struct cpustat *st, int cpunum) {
|
||||||
|
FILE *fp = fopen("/proc/stat", "r");
|
||||||
|
int lskip = cpunum+1;
|
||||||
|
skip_lines(fp, lskip);
|
||||||
|
char cpun[255];
|
||||||
|
fscanf(fp, "%s %d %d %d %d %d %d %d", cpun, &(st->t_user), &(st->t_nice),
|
||||||
|
&(st->t_system), &(st->t_idle), &(st->t_iowait), &(st->t_irq),
|
||||||
|
&(st->t_softirq));
|
||||||
|
fclose(fp);
|
||||||
|
return;
|
||||||
|
}
|
||||||
|
|
||||||
|
double calculate_load(struct cpustat *prev, struct cpustat *cur) {
|
||||||
|
int idle_prev = (prev->t_idle) + (prev->t_iowait);
|
||||||
|
int idle_cur = (cur->t_idle) + (cur->t_iowait);
|
||||||
|
|
||||||
|
int nidle_prev = (prev->t_user) + (prev->t_nice) + (prev->t_system) + (prev->t_irq) + (prev->t_softirq);
|
||||||
|
int nidle_cur = (cur->t_user) + (cur->t_nice) + (cur->t_system) + (cur->t_irq) + (cur->t_softirq);
|
||||||
|
|
||||||
|
int total_prev = idle_prev + nidle_prev;
|
||||||
|
int total_cur = idle_cur + nidle_cur;
|
||||||
|
|
||||||
|
double totald = (double) total_cur - (double) total_prev;
|
||||||
|
|
||||||
|
double idled = (double) idle_cur - (double) idle_prev;
|
||||||
|
|
||||||
|
if (totald == 0 && idled == 0) return 0;
|
||||||
|
|
||||||
|
double cpu_perc = (1000 * (totald - idled) / totald + 1) / 10;
|
||||||
|
|
||||||
|
return cpu_perc;
|
||||||
|
}
|
@ -0,0 +1,24 @@
|
|||||||
|
#include "sys/types.h"
|
||||||
|
#include "sys/sysinfo.h"
|
||||||
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#include "stdlib.h"
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||||||
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#include "stdio.h"
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||||||
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#include "string.h"
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||||||
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#include "sys/times.h"
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||||||
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#include "sys/vtimes.h"
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void getTotalVirtualMem();
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void getVirtualMemUsed();
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int getVirtualMemUsedByCurrentProcess();
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struct cpustat {
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unsigned long t_user;
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unsigned long t_nice;
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unsigned long t_system;
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||||||
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unsigned long t_idle;
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unsigned long t_iowait;
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||||||
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unsigned long t_irq;
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unsigned long t_softirq;
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};
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||||||
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void get_stats(struct cpustat *st, int cpunum);
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double calculate_load(struct cpustat *prev, struct cpustat *cur);
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@ -1,8 +1,10 @@
|
|||||||
#include "genlib.h"
|
#include "genlib.h"
|
||||||
#include <math.h>
|
#include <math.h>
|
||||||
#include <stdio.h>
|
#include <stdio.h>
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||||||
|
#include "log.h"
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||||||
|
|
||||||
/*power covariance function*/
|
/*power covariance function*/
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||||||
double power(double h, double alpha) {
|
double power(double h, double alpha) {
|
||||||
|
log_info("RESULT = in progress, h = %f, alpha = %f", h, alpha);
|
||||||
return pow(h, alpha);
|
return pow(h, alpha);
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||||||
}
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}
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||||||
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@ -0,0 +1,2 @@
|
|||||||
|
python3 setup.py install --user
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||||||
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ENV=analysis python3 example.py $1 2>&1 | split -l 5000000 - log_$1_improvement-file-array-
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